В 1972 году — начальник агрономического отдела Моквского эфиромасличного совхоза, служба в армии, затем на комсомольской работе — инструктор Абхазского обкома комсомола.

В 1978 году — зав. сектором информации ЦК ЛКСМ Грузии, заведующий отделом рабочей и сельской молодёжи ЦК ЛКСМ Грузии.

В 1980 году — первый секретарь Абхазского обкома ЛКСМ Грузии.

В 1982 году — 1-й секретарь Очамчирского РК КП Грузии.

В 1992 году — 1-й заместитель председателя Совмина Абхазской АССР.

В 1993 году — 1-й заместитель председателя Совмина Республики Абхазия.

В 1995 году — 1-й вице-премьер Республики Абхазия.

В период войны 1992-1993 гг. Багапш занимался материально-техническим обеспечением обороноспособности Абхазии, прежде всего — оружием, боеприпасами, горючим, медикаментами, продовольствием. Вёл большую организаторскую работу среди добровольцев Юга России и Северного Кавказа, опыт, знания и связи Багапша в Москве имели колоссальное значение для жизнеспособности республики в период блокады. Участвовал также в переговорном процессе по мирному урегулированию грузино-абхазского конфликта.

При С. Багапше была восстановлена юрисдикция Абхазского государства в верхней части Кодорского ущелья, контролируемого после войны грузинскими властями.

Именно при Багапше состоялось официальное признание Абхазии как суверенного и независимого государства Россией 26 августа 2008 года, а затем Венесуэлой, Никарагуа, Науру и Тувалу.

Возглавляемая Сергеем Багапшем официальная делегация Республики Абхазия в августе 2010 года впервые с ознакомительным визитом посетила страны Латинской Америки.

При президенте Багапше впервые после признания Россией независимости Абхазии, республику с рабочим визитом посетил премьер-министр РФ Владимир Путин (2009 г.), а в августе 2010 г.  тогдашний президент России Дмитрий Медведев.

Второй президент Абхазии Сергей Багапш скончался на 63-м году жизни, 29 мая 2011 года, через неделю после операции на легком, сделанной ему в Москве, в 83-й клинической больнице Федерального медико-биологического агентства России. С.В. Багапш похоронен на родовом кладбище в селе Джгярда Очамчырского района, где покоятся его родители.

***

Из воспоминании разных лет о втором Президенте Абхазии  Сергее Багапше

Бывший вице-президент Михаил Логуа:

«Достигнув больших высот в политике, Сергей Васильевич смог, в первую очередь, остаться человеком. Иногда он бывал вспыльчив, но быстро отходил. Его отличало умение прощать. Никогда не опускался до мелочей, всегда старался объединить людей.

Если бы не трагическая смерть, он бы еще много сделал для Абхазии и нашего народа. И, возможно, мы сейчас находились бы совсем в другой ситуации.

Мне вспоминается, как во время его рабочих поездок по городам и районам республики, где бы он ни остановился, вокруг него сразу же собиралось много людей – и взрослых, и детей. Сергей Васильевич находил со всеми общий язык, откликался на волновавшие людей проблемы, обещал помочь и помогал.

Экс-президент Южной Осетии Эдуард Кокойты:

«Для меня он был больше, чем коллега и товарищ, для меня он был как старший брат... Сергей Васильевич Багапш сделал чрезвычайно много для развития абхазской государственности и способствовал официальному признанию независимости Абхазии. … Я убежден, что Сергей Багапш, как и Владислав Ардзинба навсегда останутся в памяти абхазского народа, в пантеоне его величайших политических и общественных деятелей"

Первый посол РФ в Абхазии Семен Григорьев:

«Всю свою жизнь Сергей Васильевич посвятил борьбе за свободу, независимость и процветание своей Родины. Он войдет в историю как выдающийся политик, при котором начался процесс признания независимости Абхазии. С. В. Багапш был настоящим другом России и делал для развития всесторонних традиционных связей между нашими странами».

Политолог Николай Злобин:

«Я много раз в разных ситуациях встречался и общался с Сергеем Багапшем. Он был очень умным и обаятельным человеком. …

Сергей Багапш был сильным и умным политиком. Он был спокойным, смелым, веселым и глубоко порядочным человеком, обладающим талантом настоящего государственного деятеля высокого уровня.

Безусловно, он был харизматической личностью. Багапш пришел к власти вопреки пожеланиям Москвы, но заставил ее считаться с ним всерьез. В отличие от многих политиков на постсоветском пространстве он пользовался искренней поддержкой собственного народа. Удивительно, но небольшая Абхазия дала двух незаурядных политиков — самого Сергея Багапша и его предшественника, первого президента страны Владислава Ардзинбу.

Многие сегодня забывают, что, во-первых, независимость Абхазии началась не после признания ее Россией в августе 2008 года, а в результате ее собственного желания добиться этой независимости и победы в вооруженном конфликте с Грузией 15 годами раньше. Во-вторых, признание Россией Абхазии отнюдь не было благотворительным жестом со стороны Москвы, а соответствовало стратегическим национальным интересам России в этом регионе и международной политике в целом. Я с самого начала поддерживал это решение и до сих пор полагаю, что это был сильный шаг Дмитрия Медведева. Россия получила не только союзника в нестабильном регионе, но и возможность защищать и продвигать свои интересы на Кавказе. Грузия потеряла Абхазию в результате собственных политических ошибок.

В результате деятельности Сергея Багапша и его команды сегодня есть гораздо больше оснований считать, что Абхазия состоится как независимое государство. Причем как демократическое государство. Хотя препятствий на этом пути есть еще немало, а некоторые из них выросли уже после признания Абхазии со стороны России. Нельзя забыть мудрую позицию, которую занял Сергей Багапш во время событий августа 2008 года, не поддавшийся на уговоры, посулы и угрозы с различных сторон.

Смерть президента Багапша стала неожиданностью. Это трагедия для небольшой страны. Но я знаю, что среди его коллег есть люди, более чем способные вести дело государственного строительства демократической Абхазии дальше. Более того, способные добиться ее большего международного признания, без которого очень трудно проводить свою независимую политику. Такое признание — вместе с развитием национальной экономики — станет одной из главных задач будущего президента Абхазии.

… На постсоветском пространстве идет процесс складывания новой политической географии, стартовавший двадцать лет назад. Сергей Багапш внес свой заметный вклад в то, чтобы в этом важном процессе Абхазия участвовала в качестве одного из игроков, а не пассивного заложника чужих распасовок. Народ Абхазии должен быть глубоко благодарен этому человеку. Однако ему не менее благодарна должна быть Россия. Думается, что настанет время, когда на роль Сергея Багапша в постсоветской политике смогут смотреть по-другому даже в Грузии. Он был очень миролюбивым человеком и мог бы повторить слова великого грека Перикла, удерживавшего 15 лет Афины от войны: «пока я мог, я никого не заставил носить траур». В наше время далеко не все политики могут этим похвастаться».

Заведующий кафедрой журналистики Абхазского госуниверситета, доктор философских наук Гурам Амкуаб:

Сергей Васильевич - это большой политик! Его имя связано с признанием Абхазии, и оно должно быть вписано в историю страны.

Сергей Васильевич родился и рос в скромной семье служащего. И, приняв решение прийти во власть, не преследовал цель приобрести какие-то блага, а посвятил себя народу Абхазии».

Сергей Васильевич очень любил спорт, сам занимался им  и всячески помогал спортсменам.

 Баскетбол присутствовал в жизни будущего Президента со школьных лет. Помню спортплощадку в Сухумской школе N°10.  Когда играл Багапш, все знали, что его команда должна выиграть. И если команда проигрывала, что случалось редко, он места себе не находил,  обязательно старался в следующей игре привести ее к победе. Багапш не прощал себе поражений. В этом - его характер. Багапш играл за сборную Абхазии, участвовал в международных соревнованиях. Даже работая на высоких должностях, не оставлял баскетбол».

Не могу не отметит, что с Сергеем Васильевичем легко работалось. Он  никогда не проявлял категоричности, был невероятно чутким человеком, не позволял себе грубость и оскорбительные выпады. Он спокойно относился к любой позиции, любому мнению».

Сергей Васильевич любил совершать добро и помогать людям. При этом, для президента было важно, чтобы все вопросы решались в правовом русле, и он всегда способствовал этому.

Багапш придавал большое  значение  развитию СМИ. «Когда я работал на телевидении, часто внедрялось что-то новое, и Багапш этому радовался. В 2011 году
был запущен сайт АГТРК. Сергей Васильевич пришел поздравить нас. Беседа длилась около часа. Он попросил подготовить список людей, которые заслуживают поощрения. Но в связи с отъездом в Москву Сергей Васильевич не успел подписать документ. К сожалению, так получилось, что Багапш уже не смог приехать».

… Хочется вспомнить моменты, когда приезжали корреспонденты  российских СМИ, просили  интервью Сергея Васильевича, и мы, как работники радио и телевидения, способствовали этому. После интервью мне часто приходилось слышать впечатления журналистов, которые беседовали с Сергеем Васильевичем. Так, например, один из ведущих журналистов, политический комментатор Шевченко, который в очередной раз получил интервью Сергея Васильевича, говорил: «Какой большой политик! Мне думается, что такой политик, как Сергей Васильевич, не только президент Абхазии, не только представляет Абхазию. Мне кажется, он сегодня на всем Кавказе становится лидером, потому что выражает и защищает точку зрения всего Кавказа». Другой журналист говорил: «Вот таким президентом вы можете гордиться!» Думаю, и многие другие ведущие журналисты давали высокую оценку Багапшу. Конечно, нам это было очень приятно слышать. Это дорогого стоит! Сергей Васильевич всегда находил время пообщаться с людьми.

Когда он бывал в зарубежных поездках, в районах, в селах - везде его очень тепло встречали. И каждого,  кто к нему подходил, президент всех выслушивал, старался помочь.  

Сергей Багапш, как достойный сын своего народа, навсегда останется в наших сердцах».